故事设定在第二次世界大战后，日本的国家主权受制于美国。90年代中期。日本首都制药公司在大脑机能领域开发出了新药。新进和平塾得知后开始推行雅典娜计划。共聚集了26个小于5岁的孩子，人工培养出类学者症候群。但药物严重的副作用导致孩子相继死亡，最终计划以失败告终。在这些孩子中NINE和TWELVE一起逃出了试验基地，而未曾逃走但幸存下来的FIVE则秘密被美国政府收留。
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九重新NINE，动漫《恐怖残响》中的主人物之一，拥有冰一般的眼神，聪明、冷静，转学到东京的高中生。但真实目的是谜。戴眼镜，擅长电脑，通过侵入电脑来获取资料，不太信任三...
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久见冬二，《恐怖残响》的主要人物之一，表面上像孩子一样天真拥有如骄阳的笑容，但其实内心腹黑，非常尊敬信任NINE，觉得他像哥哥一样，跟他一起转学到东京，两人经常一起行...
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三岛理沙，动漫《恐怖残响》中的人物，与NINE和TWELVE在一所学校上学。
在学校受欺负，家庭内部也有问题（母亲在被丈夫抛弃后开始过度关心她，总是疯狂的发短信给三岛，想把...
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柴崎健次郎，所属动漫《恐怖残响》中的人物。
柴崎健次郎声优：咲野俊介柴崎健次郎是警视厅的刑警，头脑聪明，善于推理猜谜，原先在搜查一课工作。十五年前的夏天，因议员...
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Five，所属动漫《恐怖残响》中的人物。
Five声优：潘惠美年龄：15岁由美国政府和FBI派遣的NEST（核紧急支援队）的核物理学家，事实上是与NINE TWELVE小时候在同一秘密研究所里的『实...
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六笠，所属动漫《恐怖残响》中的人物。
六笠声优：かぬか 光明柴崎在文书部门的同事，是个长期在文书部门的胖子职员。后柴崎离开文书部门后也会经常回到文书部门跟此人闲聊...
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羽村，所属动漫《恐怖残响》中的人物。
羽村声优：逢笠 惠祐警察署搜查一课的警察。刚开始对突然成为他的上司的柴崎不能接受，认识到柴崎的办案能力后开始改变对他的看法。...